La forêt d'Allogny est composée essentiellement de Chênaies-hêtraies où le Hêtre est plus ou moins présent selon les secteurs. Ces boisements sont pour la plupart acidiphiles, mais des zones neutrophiles à acidiclines apparaissent ça et là. Hormis les Chênaies-hêtraie, on rencontre également des Chênaies-charmaies et surtout des Aulnaies-frênaies bordant les sources et les cours d'eau. Ce dernier type de boisement présente souvent un intérêt particulièrement fort. La forêt d'Allogny abrite en outre un cortège faunistique intéressant : Sonneur à ventre jaune, Lucane cerf-volant, Triton marbré, etc. Toutefois, les éléments d'intérêt écologique sont assez dilués sur l'ensemble de la zone et les habitats sont souvent dans un état de conservation moyen.