À l’origine, le village portait le nom de Fénayrols-les-Bains. Le thermalisme représentait autrefois une part non négligeable de l’économie du village.
La qualité des eaux thermales de Féneyrols est réputée depuis l’antiquité. Le long de l’Aveyron se trouvent les vestiges des anciens thermes romains sur lesquels a été construite la Bombouzole à la fin du XVIIe siècle. La station balnéaire a été exploitée jusqu’à la moitié du XXe siècle. Il y coulait alors deux sources. La station a été fermée en 1940 puis a été classée en 1944 aux monuments historiques de France.
Aujourd’hui, il reste la source de l’église Saint-Jean-Baptiste, réputée pour ses vertus médicinales.