Histoire:
La commune fut rattachée au département de Tarn-et-Garonne à la création de celui-ci par Napoléon Ier le 4 novembre 1808. Elle faisait jusqu'alors partie du Lot-et-Garonne en compagnie du canton de Valence d'Agen.
Les pendus de 1944:
Durant la Seconde Guerre mondiale, " le bourg de Dunes a le triste privilège d'être classé au rang des villages martyrs. En effet, le 23 juin 1944, une unité de SS cantonnés non loin de là, dans le chef-lieu du canton voisin de Valence-d'Agen, recherche des « résistants ». Ces derniers auraient été préalablement dénoncés par deux femmes du village voisin. L'officier SS a, en effet, une liste de 42 noms. Après avoir fait rassembler près de 70 hommes sous les arcades de l'ancienne bastide tarn-et-garonnaise, les Allemands installent des tables sous le balcon de la poste. Une macabre cérémonie commence, douze, un par un sont appelés et pendus au balcon, un treizième qui tente de s'échapper est abattu. Trois autres villageois avaient été un peu plus tôt, et sans raison, abattus dans un champ de la commune.