L'église en briques de Villers les Pots date du XVIème siècle. Observez, au sommet de son clocher en pierre, la fine flèche recouverte d'ardoise.
L'église, incendiée au XVIIème siècle, a été en grande partie rénovée depuis le XIXème siècle. En 1841, le clocher est reconstruit, en 1859-61 un mur est ajouté avec une grille en fer devant l'église, en 1862 des marches sont installées au bas du clocher et en 1880 le clocher est agrémenté d'une horloge. L'église est éclairée par de beaux vitraux : en 2007, ils ont été nettoyés et certains remplacés.
Le nom de l'église rend hommage au saint béatifié en 1923. Saint Michel GaricoIts (1797-1863) né au Pays Basque a fondé la congrégation de Prêtres Auxiliaires pour les missions et l'éducation de la jeunesse dans le diocèse. Son institut est toujours actif en Europe, en Amérique du Sud et en Chine.
La chapelle Sainte-Philomène : restaurée en 2018, c'est le seul reste de l'église gothique initiale. Elle abrite des carreaux de faïence de l'ancienne faïencerie de Villers les Pots, le tombeau de de Sainte-Philomène ainsi que des statuettes de la sainte à la main brisée. Il était d'usage de briser la main droite de la statuette avant de faire un voeu.