Aprés la deforestation du XVI siecle , St trojan acceuillait betail et marais salant . L'avancée du sable recouvrit ces zones habitées et le bourg de st trojan dont le clocher emergeait juste , dut se deplacer sur le site actuel .
La foret de St Trojan fut plantée sur la dune gagnée grace aux palissades pendant le XIX siecle.. Palissades des ponts et chaussées , Palissade de 1864 , de 1876, forment de longs cordons enserrant de longues depréssions humides.Ce sont d'ancien marais salés , maintenant isolés de la mer ou des cuvettes recreusées par le vent.
La nappe phréatique , peu profonde emerge a certains endroits et conditionne une vegetation differente , aulne , peuplier dont profite la faune.