Le périmètre du contrat territorial est celui du Parc Naturel Régional (PNR) de la Brenne dans son ensemble, soit 51 communes dans le département de l’Indre. Le territoire se situe à 70 % dans le bassin de la Creuse et 30 % dans le bassin de la Vienne. Les principaux cours d’eau concernés sont la Claise, la Creuse et l’Anglin.
Les zones humides représentent 20 à 30 % de la surface du territoire soit entre 40 000 et 50 000 ha, dont 4 234 plans d’eau pour 9 224 ha. Façonnées par l’homme au cours des siècles, les zones humides sont imbriquées dans une mosaïque de milieux composée de prairies, landes, boisements, étangs. Avec 4 sites Natura 2000 et 80 % de sa surface désignés au titre de la convention Ramsar, le territoire est un haut lieu de biodiversité, reconnu internationalement.