La commune est entièrement traversé par le cours de l'Eure, sur une longueur d'à peu près 5,2 km dont 800 m environ comme limite séparative avec la commune de Champhol. Sur ce parcours, l'Eure reçoit à droite, un affluent de peu d'importance, drainage de la grande plaine de Beauce, qui prend sa source à Sours et vient se perdre dans la rivière, en face du village de Saint-Prest en aval du moulin de Plateau. Ce petit cours d'eau est connu à Saint-Prest sous le nom de rivière d'Oisème ou Souriette, il porte aussi le nom de Roguenette ou Raguenette, à cause d'un moulin détruit depuis longtemps, qui se trouvait à l'extrémité de la commune.
La sortie récente du livre sur l'histoire du village :
« La mémoire de Saint-Prest, des origines aux années 50 », c'est le livre écrit par Yvette Biget-Ternon et paru il y a peu. Un ouvrage de 600 pages où l'auteure retrace le parcours de son village. Un livre richement illustré qui mêle histoire, souvenirs et témoignages sur la vie de Saint-Prest. Yvette Biget-Ternon explique pourquoi elle a écrit ce livre.
Vous voila dans mon village qui m'a adopté il y a maintenant plus de 25 ans.