L'Issole présente des fluctuations saisonnières de débit assez marquées, avec des hautes eaux d'automne-hiver portant le débit mensuel moyen à un niveau situé entre 1,80 et 3,07 m3/s, de novembre à mars inclus (avec un maximum très net en janvier), et des basses eaux d'été, de juillet à septembre inclus, avec une baisse du débit moyen mensuel jusqu'à 0,21 m3/s au mois d'août.