En février 1990, une crue centennale de la Savoureuse cause de lourds dégâts dans toute l’Aire urbaine, chez les particuliers et au sein d’entreprises comme PSA à Sochaux. Pour éviter le renouvellement d’une telle catastrophe, le Conseil général a alors mis en oeuvre un programme de restauration des rivières et de maîtrise des inondations, en partenariat avec le Pays de Montbéliard. Lors de la crue des 29 et 30 décembre 2001, la rupture de trois bassins de rétention a causé d’importants dommages à Éloie et Valdoie. Les expertises ont mis en évidence la responsabilité du concepteur et de l’entreprise, mais ont aussi confirmé l’intérêt du projet.