La première église de Bonnelles fut probablement construite par les moines bénédictins du monastère Saint Martin Des Champs à Paris au cours du 9ème ou 10ème siècle.
L’église paroissiale actuelle correspondrait à une reconstruction du 13èmesiècle par un Prieur de Bonnelles.
La tour du clocher et le mur du fond ont une allure massive presque fortifiée. Les fenêtres de cette partie de l’église sont de style Roman.