Même si le monastère de Montfavet est relativement récent, les soeurs Clarisses ont une implantation très ancienne à Avignon. En effet c'est aux environs de 1230, du vivant de Claire d'Assise, qu'une première communauté est arrivée à Avignon. Elle construisirent au courant du XIIIème siècle un couvent qui fut à nouveau rebâti au XIVème, rue du Roi René. Elles y résidèrent jusqu'en 1792, moment où elles furent, comme toutes les congrégations religieuses, chassées par les forces révolutionnaires qui saccagèrent les lieux.
Ce sera en novembre 1941, que six soeurs, venues du Monastère Sainte Claire de Nice-Cimiez, vont s'installer à Montfavet dans la première bâtisse qui sert aujourd'hui de maison d'accueil. D'autre soeurs arriveront et, pour les besoins de la communauté, les bâtiments actuels vont être construits.
Le monastère (et sa chapelle Notre-Dame-Des-Miracles) est l'oeuvre de Clément GOYENECHE (1893-1984), Architecte dans le domaine de l'Art sacré.