La commune de Parcey est établie à l’extrémité occidentale de la basse vallée de la Loue, dans la plaine alluviale au confluent Doubs et Loue, à quelques kilomètres au sud de Dole et à une altitude moyenne de 200 m. Ce terroir de plaine alluviale est à la fois riche et dangereux. Les inondations de la Loue sont en effet redoutables, aggravées à l’extrémité aval du Val d’Amour par l’arrivée de la Clauge qui draine la région imperméable de la Forêt de Chaux, et par la proximité du Doubs qui freine parfois l’écoulement du flot de la Loue. Mais la fertilité de cette sorte de delta intérieur que constitue le bas Val d’Amour explique l’opiniâtreté avec laquelle Parcey s’est accroché au cœur de cette plaine alluviale, au milieu du danger. Ce sont les alluvions de la plaine qui constituent la quasi-totalité du terroir ; riches à la fois en graviers, en argiles, et grâce aux apports de la Loue, en calcaire, ces alluvions donnent en principe un excellent sol agricole, l’un des meilleurs du Jura : sol équilibré, meuble, chaud, facile au travail et de bon rendement.