Une présence Juive à Habsheim est attestée dès la fin du 15ème siècle.
Entre la seconde moitié du 18ème siècle et 1850, la communauté s'est considérablement agrandie pour constituer plus de 12% de la population.
C'est probablement à cette époque qu'une synagogue fut construite, alors que le siège du rabbinat était à Rixheim.
Ayant d'abord lentement diminué sous le Second Empire, le nombre de Juifs a ensuite fortement régressé à l'époque du Reichsland (1871-1918).
Un enseignement hébraïque suivi était dispensé dans l'école contigüe à la Synagogue.
Déclassé, toujours existant, le bâtiment a finalement été vendu en 1926 et appartient au domaine privé.
Son architecture intérieure a fait récemment l'objet d'un relevé par le service de l'inventaire des Monuments Historiques.
