Vuonna 1929 Lappeenrannan kotiseutuyhdistys lähetti Kansallismuseoon kivikautisia saviastianpaloja, jotka olivat löytyneet Vaaterannasta rakennuksen perustusta kaivettaessa. Jo seuraavana vuonna Vaaterannassa tehtiin ensimmäinen arkeologinen tutkimus. Vuonna 1970 uimarannalle johtavan tien itäpuolelta saatiin ensimmäiset viitteet punamultahaudoista. Siksi alueella tehtiin kaivauksia 1970-1971.
Ensimmäiset asukkaat olivat asettuneet Vaaterantaan nähtävästi pian vuoden 5000 eKr. jälkeen. Maankohoamisesta ja -kallistumisesta johtuen Saimaan vedenpinta oli noususuunnassa, kunnes Vuoksi puhkesi noin 3800 eKr., vedenpinta laski ja rantaviiva Vaaterannassa loittoni. Tämän jälkeen paikalla on asuttu yhtäjaksoisesti muutamia satoja vuosia. Löytöjä on myös kivikautta seuranneelta vanhemmalta metallikaudelta, joka jatkui ajanlaskun alkuun saakka. Siten esihistoriallinen asutus on Vaaterannassa kestänyt peräti 5000 vuotta.
