Železniční trať Horní Cerekev – Tábor byla postavena jako součást českomoravské transverzální neboli příčné dráhy. Obecní zastupitelstva v Pelhřimově se usneslo, že ke stavbě dráhy poskytne zdarma pozemky a stavební materiál, jestliže nádraží bude postaveno u města, u pražské silnice nebo u vlásenické silnice v místech poblíž Kalvárie. Mimo to prodá obec železničnímu eráru dle možností stavební dříví a cihly v cenách nižších. Předběžný projekt však směroval trasu od tzv. „Maštálek“ nad rybníkem Stráž přímo ke Lhotkám a nádraží mělo být proti dvoru Lhotky. Purkmistr a členové městské rady jednali s vídeňskými úřady o přiblížení nádraží k městu a obec také slíbila vykoupit pozemky, potřebné pro stanici. Stavba nádražní budovy byla zahájena stavba 27.6.1887 podle normálie č. 16a/H, zřejmě podle návrhu architekta F. Setze, jako kombinace režného zdiva s kamennými prvky na nárožích a dřevěným obložením štítů.
Při stavbě nádraží byly provedeny značné zemní práce. Úsek ve skále má ca 200m, navazující násep u nynějších Kamenných dvorů v oblouku asi 500m, výška je 12-15m. Na druhé straně nádraží bylo nutné provést širokou navážku v prostoru tehdy již vypuštěného rybníka Háje, částečně přesunout silnici a vykácet mnoho vzrostlých stromů
Zajímavým způsobem zajistila železniční správa dostatečné množství vody pro zbrojení parních lokomotiv. Bylo sjednáno tzv. „Právo k vodě“ v rybníku Stráž, smlouvou se zdejší obci na věčné časy, za 60 zl. ročního odškodnění s dodatkem, že železniční správa nepřipustí pokles vody pod normální stav a že rybník se smí lovit jen při plné vodě. Z rybníka vede více než kilometr dlouhé litinové potrubí gravitačního vodovodu do nádražní vodárny. Část potrubí je dnes využívána zahrádkáři, dosud stojící nádražní vodárnu si můžete prohlédnout u táborského kolejového zhlaví stanice.
Provoz na dráze byl slavnostně zahájen v neděli 16.prosince 1888. Pelhřimovskou obcí byl objednán i věnec od květinářské firmy Z. Dittrich v Praze, pravděpodobně jím byla ozdobena lokomotiva. Večer po zahájení jízdy byl uspořádán banket v hostinci u Martinců.
V roce 1982 bylo rozhodnuto o stavbě nové staniční budovy, bylo vystavěno dopravní provizorium z pěti stavebních buněk a stará budova byla v roce 1985 zbořena. Provoz nové výpravní budovy byl slavnostně zahájen v pátek 29.4.1988. Její současná podoba je výsledkem modernizace, která proběhla v roce 2007-2008, kdy bylo staré opláštění z tzv. boletických panelů vyměněno za klasickou fasádu. A tuhle hranatou nádheru si cestou ke keši můžete prohlédnout i Vy.