Autrefois, cette église était le lieu de culte de la ville d'Agonnay. Aujourd'hui, entièrement rénovée et de style roman, cette église conserve à l'intérieur un tableau datant du XVIIIème siècle représentant saint Jean-Baptiste ainsi qu'une cuve baptismale portant la date de 1684.
Attention le passage à niveau est interdit aux véhicules surbaissés et après la voie ferrée, le chemin est parfois innondé à marée haute.