Jusqu'au 19ème siècle, la Loire était abondamment fréquentée par un grand nombre de poissons effectuant une partie de leur cycle de vie en mer et une partie en rivière : anguille, saumon, alose, lamproie.
Les nombreux aménagements des cours d'eau à partir du 19ème siècle (barrages), la dégradation de la qualité des eaux on eu un impact fort sur ces populations. Mais depuis quelques année, la pollution est en constante diminution (nitrate), et on a vu revenir une espèce emblématique de la Loire, le saumon, dont la pêche est très réglementée.
Autre espèce ayant élue domicile, dans la région est le « Silure », on peut attraper de très grosses pièces du coté de St Laurent des Eaux, du fait de rejet d’eaux tempérées dans la Loire. C’est le plus gros poisson vivant dans les fleuves 1.50 en moyenne, on parle de taille record de 2.50m et 110 kg. (en Europe centrale).