No início do século XX, as diferentes chácaras do bairro, os diversos armazéns e as várias fábricas, não bastariam para sedimentar a comunidade do bairro do Portão. A partir daí foi, então, idealizado um local de devoção e espaço comunitário para a população do bairro.
A Igreja do Portão foi construída entre 1916 e 1928, ao redor da mesma capelinha antiga feita no início do século XX, de tijolos de barro e que ali permaneceu enquanto se erguiam os muros da futura igreja, que seria dedicada ao Senhor Bom Jesus.
O impulso da construção aconteceu só em 1920, quando o bispo Dom João Braga, preocupado com a escassez de esmolas, nomeou nova comissão composta de Pedro Zagonel, Attílio Brunetti e José Bettega. A parte final da construção que foi o telhado ficou pronta em 1923, estrutura esta, que se mantém até hoje.
A Igreja que foi inaugurada em 1928 foi elevada a Paróquia no dia 15 de dezembro de 1936 e tornou um ponto tradicional de devoção para os moradores e fieis do Portão na época e até hoje. A administração está a cargo dos padres e irmãos da Congregação dos Oblatos de São José desde 1928, desde a sua inauguração.
A pintura interna é de 1949. Merece destaque também os quatro sinos existentes na Igreja, instalados em 1952 que vieram diretamente da Alemanha.
Em 1986, em comemoração aos 50 anos de história o local recebeu uma ampla reforma interna. E em 1990, a igreja antiga foi tombada pelo patrimônio histórico do município. Ps.: movimentação intensa de muggles