Port Maubert a succédé à un port plus ancien, Port Neuf, aménagé à l’intérieur des terres au pied de la butte de Beaumont. Le port de Beaumont a été abandonné au XVIème siècle. Les vases de la Gironde rendirent la navigation impossible et le port fut déplacé plus près de la rive de l'estuaire.
Blotti au fond d’une anse bien marquée, exposé aux vents de sud, le chenal de Port Maubert est formé par l’embouchure dans la Gironde du cours d’eau de Maubert. Il est entièrement creusé dans un sol d’alluvions.En 1642, au cours des combats navals en Gironde entre les flottes française et anglaise, Richelieu débarqua à Maubert pour regagner l’arrière pays ; et la flotte anglaise y a stationné et s’est servi de ce port pour se ravitailler.
En 1835 fut construit un débarcadère servant aux marins et marchandises qui venaient de Bordeaux. La minoterie de Maubert naquit en 1880 et apporta l’aisance et la prospérité à cette population maritime jusqu’en 1903.Aujourd’hui devenu port de plaisance avec cale de mise à l’eau, Port Maubert offre un peu plus de 70 anneaux.
Une aire de repos a été aménagée, et une table d’orientation vous permettra de vous situer sur l’estuaire.