L'ile la plus proche est l'Ile des Morts. Derrière elle se trouve l'Ile de Trébéron.
En 1690, un lazaret est installé sur Trébéron (lieu où l'on met les gens en quarantaine) , afin d'éviter la propagation d'épidémies telles que peste, fièvre jaune, choléra… apportées par les navires revenant d'expéditions. Les morts étaient enterrés sur l'ile adjacente, qui prit le nom d'Ile des Morts.
Au 19e siècle, en plus d'être un lieu de soin,Trébéron devint une prison à certaines périodes. Quant à l'Ile des Morts, on y transféra la principale poudrière de Brest.
Depuis 1960, ces terres sont dans le périmètre de protection de l'Ile Longue (située à l'arrière) , et sont interdites d'accès. Leur entretien est réalisé conjointement avec le Conservatoire du Littoral.
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