Historie Jindrišske je poznamenána jednou z morových morových epidemií v 16. století kdy vesnice zcela vymrela, znovu ji osídlili až poddaní z Vinaric. Z roku 1565 pochází první písemné dokumenty o Jindrišské.

Od roku 1579 obec už k Cervenému hrádku nepatrila, Kryštof z Karlovic Jindrišskou stejne jako Vinarice prodal lobkovickému hejtmanovi na Hasištejne a majiteli panství Ahníkov, který obe obce pripojil ke statku Bolebor. Statek pak na cas patril pod panství Brezno, od roku 1680 opet k Ahníkovu. Živnost obyvatel byla prevážne zemedelská na žitných polích a minimu luk.

V roce 1787 mela obec 23 domu v nichž hospodarilo 12 chalupníku a stejný pocet domkaru, celkem asi 130 obyvatel. Jindrišská byla farne pridelena k Jirkovu. Obyvatelé se živili tkaním, pletením, pestováním lnu a výrobou plátna. Pestovali žito, jecmen, oves a pozdeji i brambory. Poddaní museli cást svých výdelku odevzdávat panství, stejne tak museli pro Ahníkovské pány odpracovat urcený pocet hodin. Od roku 1850 zkoušeli v Jindrišské dokonce pestovat chmel. V obci tehdy žilo 150 obyvatel. V nedalekých lomech se lámal kremen a rula pro stavební využití. V blízkém Telšském údolí využívaly proudu rícky Belé dve pily a ctyri soustružny dreva. Ve vsi byly 2 rybníky, jeden z nich se dodnes zachoval na návsi. Obec v roce 1850 získala samostatnost, dokonce k ní patrila osada Vinarice. Roku 1868 se stejne jako Vinarice stala Jindrišská osadou mesta Jirkova. Díky nedbalosti dvou chlapcu obec 22. zárí 1870 málem podlehla plamenum. Ctvrtina domu tehdy lehla popelem.

Do pocátku 80. let 19. století Jindrišskou neprocházela silnice, pouze polními cestami byla obec pripojena ke spojnici Cervený Hrádek - Kalek. V letech 1877 - 1882 obyvatelé obce za prispení Jirkova konecne silnici vybudovali. V techto casech žilo v obci 188 lidí, nejvíce obyvatel v její historii.