Zacetki samostana, ki je najstarejši samostan Franciškovih manjših bratov na slovenskih tleh, segajo v 13. stoletje. Zgodovinski viri pricajo, da so ga leta 1239 ustanovili gospodje Ptujski. Leta 1931, ko so prenavljali notranjost cerkve, so našli v ladji za stranskima oltarjema slabo ohranjeno fresko sv. Franciška Asiškega iz druge polovice 13. stoletja, ki potrjuje nastanek cerkve pred letom 1260. Iz tega casa je tudi kip gotske Marije, ki so ga imenovali »Ptujska minoritska Madona«.
Po požaru, ki je izbruhnil verjetno v zacetku 16. stoletja, so samostan dogradili, ga dvignili za eno nadstropje in obogatili s križnim hodnikom. Najvecje spremembe je doživel v zadnjih desetletjih 17. stoletja po zaslugi gvardijana patra Gašperja Dietla. Leta 1687 je bila na levi strani cerkvene ladje s prispevki družine Sauer z Borla prizidana Lavretanska kapela. V petnajstletni dobi pregrajevanj so samostan in cerkev temeljito barokizirali. V tem casu je bila z darovi družine Curti iz Rogatca dograjena kapela sv. Antona (1680). Prezbiterij so 1685 prezidali, za šilastim lokom postavili glavni oltar, za oltarjem zakristijo, nad njo pa meniški kor. Leta 1690 je bilo dokoncano monumentalno procelje cerkve, delo Dionisa Merlina, stavbenika iz Lugana. Istega leta sta italijanska mojstra Anton Ouadrio in Peter Bettini opravila štukaturna dela v samostanski obednici (refektoriju) in v sobi, kjer je danes samostanska knjižnica. Freske v refektoriju naj bi naslikal brat Rupert Vallauer. Leta 1696 pa je bil samostan dokoncno prenovljen. Leta 1751 je bil v cerkev postavljen velik barocni oltar, na vrhu pa dodan kamnit kip Marije z Detetom v narocju, ki ga je Jožef Straub iz gotskega sloga predelal v barocnega. Danes je vidna kopija na stebru glavnega oltarja. Leta 1752 je cerkev dobila odlicno barocno leseno opremo, in sicer štiri oltarje, zakristijsko opremo, lesene kipe, ki so tudi delo mizarske delavnice Jožefa Strauba. Danes so vidni v prezbiteriju na stebrih z leve proti desni sv. Ludvik, sv. Francišek Asiški, sv. Anton Padovanski in sv. Bonaventura.
Župnija sv. Petra in Pavla je bila ustanovljena leta 1785, ko so prenesli sedež župnije od sv. Ožbalta v samostan. Zajemala je okolico Ptuja, ki je govorila slovensko. Ker je bilo mestno prebivalstvo Ptuja vecinoma nemško govorece, so se slovensko govoreci verniki zbirali v samostanski cerkvi. Zato je veljala za "slovensko" cerkev.
4. januarja 1945 je cerkev doživela bombardiranje in v trenutku je postala kup ruševin. Takoj po vojni, ko so se izgnani bratje minoriti vrnili, so si pri zadevali za obnovo. Vendar niso uspeli. Takratna komunisticna oblast temu ni bila naklonjena in na mestu cerkve je bila sezidana pošta. Barocni refektorij samostana je postal bogoslužni prostor. Ob 750-letnici samostana, leta 1989, je bil obnovljen prezbiterij nekdanje cerkve, ki je postal "zacasna cerkev". Leta 2001 so pošto porušili in zacela se je gradnja cerkve, ki je bila blagoslovljena 2004. Barvna okna so delo umetnice Mire Licen Krmpotic iz Pirana. Predstavljajo sedem zakramentov in sv. Cecilijo, zavetnico cerkvene glasbe in petja. Križev pot pa je delo domacega akademskega kiparja in restavratorja g. Viktorja Gojkovica.
Samostan ima tudi danes pomembno kulturno in izobraževalno dejavnost. Od leta 2007 deluje v njem zasebna samostanska glasbena šola. Med ostalimi dejavnostmi je tudi Društvo izobražencev Viktorina Ptujskega z bogatim programom. V refektoriju ali nekdanji obednici, kakor tudi na dvorišcu, se vrstijo koncerti, razstave, razlicna srecanja ... Od leta 2006 je v samostanu ponovno sedež Slovenske minoritske province sv. Jožefa.
EN
The Minorite monks arrived to Ptuj shortly after the Dominicans, in 1239, according to written records. The first time the Minorite monastery appeared in written documents seems to be the year 1280 in an undated document, while the second time the dated document bears the inscription of the year 1290. This Monastery, like the Dominican one, was established by the Lords of Ptuj. At the beginning, this was a long, narrow, single-nave and simple preacher church with a salient presbytery, the so-called "long choir", with two quadrangular vaulted bays and with a conclusion ending in five sides of an octagon. The church was decorated with paintings already in the first period of its construction. In the 13th century, the monastic buildings were humble and encompassed only the eastern part of the today's complex. In the following centuries, the church was not subject to significant changes. In the last quarter of the 17th century the Monastery, which was lead then by Casparus Dietl, quite a few Baroque elements were added. The Baroque façade, being the first of the kind on the territory of today's Slovenia, introduced a certain dynamism in the construction. The works were supervised by Dionis Merlino from Lugano. By 1696, the cloister and the three wings of the Monastery were renovated. The most excellent places in the Monastery are undoubtedly the Summer Refectory and the Minorite Library.
DE
Das Kloster wurde im 13. Jahrhundert von den Herren von Ptuj gegründet. Das heutige Klosterbild entstand zur Zeit des Barocks. Die Kirche, die als die schönste Barockperle Ptujs galt, wurde Ende des II. Weltkriegs zerstört. Sehenswert sind der Barockspeisesaal - Refektorium, die bücherreiche Klosterbibliothek und die rekonstruierte Kirche.